A ENGETEC Engenharia Jr. foi idealizada por alunos do curso de Engenharia Civil da UEFS que há certo tempo sentiam a necessidade de aplicar os conhecimentos adquiridos no curso, além de intensificar a relação universidade-empresa. Como o curso de Engenharia de Alimentos acabava de ser implantado, decidiram criar uma empresa júnior que abrangesse todos os cursos de Engenharia da UEFS.

Após diversas pesquisas e reuniões entre si e contando com o apoio dos professores, no dia 13 de setembro de 1999, estudantes de Engenharia de Civil e Engenharia de Alimentos fundaram a ENGETEC Engenharia Jr.

Em 2005, com a chegada do curso de Engenharia de Computação na UEFS, resolveram expandir sua área de atuação, acrescentando em seu portfólio projetos na área computacional, abrindo assim um processo seletivo que abrangesse também os alunos do Curso de Engenharia da Computação, porém, por possuir uma realidade diferente dos outros cursos, essa fusão não deu certo. Pouco tempo após entrarem na empresa, resolveram sair e fundar uma nova empresa com apenas um curso, três anos mais tarde surge a ECOMP Jr.

Nesse mesmo ano a ENGETEC Engenharia Jr., que se encontrava federada à UNIJr-BA, junto com mais oito empresas, tornou-se uma empresa desfederada,

Após três anos como aspirantes à refederação, a empresa volta a fazer parte do quadro de empresas federadas, regularizando a sua situação frente aos órgãos municipais, cumprindo assim todos os pré-requisitos exigidos pela Federação, com a participação dos atuais membros efetivos para essa conquista.